【课程特色】
1. 本课程通俗易懂,讲师会把难懂的理论与难学的软件教程,渗透到每个案例中,也适合零基础的学员来学习。
2. 讲师自己发表过cell,nature子刊的文章,深谙高水平文章作图的套路,保证能让你掌握顶级期刊文章的作图技巧。
3. 本课程手把手,面对面,实操性强,一些关键软件操作技巧有屏幕录制视频课后发给学员,组群学员微信群便于学员与讲师互动交流
课程过程不讲解晦涩难懂让人望而生畏的基础理论,也不灌输冗长死板使人一学就困的软件标准教程,而是把这些理论和教程融入到每个案例中,变成可操作的接地气的实战练习,即使您是理论零基础、软件零基础,也能轻松学会。同时课程讲解也不会局限于这些案例,而是通过这些案例讲解使您快速掌握理论基础和软件操作,用于其他实际案例中。案例来源于高水平科研论文,在保证简单易学时不失深度要求。本课程会让您感到有趣、易懂、不明觉厉。
【学习目标】:掌握AI,Image J,Origin等软件的实战技能
实验数据作图、拟合与分析
图像的处理、标记、通道分割、对比调节、标尺填加、蒙太奇
图像内单颗粒示踪与扩散常数计算
Origin图表在illustrator内美化
AI作图工具介绍
实验流程图及细胞信号通路图制作
蛋白质结构显示与图像生成
会议展板作图介绍
3D 分子模型构建
论文与基金申请书作图总结
基金标书与高分文章用的分子机理模式图的制作
【讲师简介】
秦老师,博士生导师。研究方向生物物理、生物光子学、生物医学虚拟场景开发。05获中科院分子发育生物学硕士学位,08年获美国东北大学物理化学硕士学位,13年获美国密苏里大学哥伦比亚生物物理博士学位与统计硕士学位,13-18年在加州大学伯克利分校博士后。目前已在Cell,Nature Communications,EMBO reports等杂志发表文章十余篇。
会议时间:2023年1月14-15日
会议地点:线上:腾讯会议网络会议室
主办方:上海循掘生物科技中心
会务费用:3000元/人
优惠措施:提前报名并付费可以提前拿到学习资料
3人组团,每人优惠100元,4人组团,每人优惠200元
6人组团,可免一人注册费(即只交5个人的费用)
科研作图班课程安排 | ||
日期 | 时间 | 内容安排 |
第一天上午 | 8:00-9:00 | 软件安装Origin, ImageJ, Adobe Illustrator, UCSF Chimera。 |
9:05-10:00 | Origin数据导入,如何根据任何方程导入新数据,根据行与列进行统计分析,如每一列的均值、方差、均值方差等。 | |
10:05-11:00 | Origin内数据的线性和非线性拟合,药物靶点结合竞争与非竞争性分析。根据任何已知方程对实验数据的模拟,柱状图和线型图制作及error bar画法。图与原始数据的对应。 | |
11:05-12:00 | Origin数据图格式修改、颜色修改、数据区间修改、横坐标线性到指数修改、坐标轴大小设置、标记修改。 | |
12:00-13:30 | 统一午餐 | |
第一天下午 | 13:30-14:30 | Adobe illustrator画图优势、画板概念、层(layer)概念、添加及删除画板和层、画板和层大小设置、画板内的分格。 |
14:35-15:30 | Selection和direct selection工具差别及使用、标准形状物体的画法、标准形状通过pathfinder整合成多样不规则形状物体、颜色样品板swatches设置、eyedropper工具使用、pencil与pen工具使用、颜色梯度使用。 | |
15:35-17:00 | Origin图表如何导入illustrator、图表在illustrator内的修改对齐、坐标轴粗细调整、标记重拍对齐、图表层内对齐、代表论文内的制图训练;细胞信号转导通路模式图和实验路线图制作。 | |
17:00-18:00 | 基金标书与高分文章用的分子机理模式图的制作 | |
晚上 | 18:30-20:00 | 作图实操串联加强训练 |
第二天上午 | 9:00-10:00 | ImageJ界面介绍、识别格式,图像和小电影的保存,图像对比度调整、图像序列堆叠与解堆叠、堆叠图像到montage转换、去除和提取图像序列或者小电影中特定的一帧或者几帧图像、图像crop、图像区间选取及强度面积计算、凝胶电影条带强度计算。 |
10:05-11:00 | 荧光显微镜照片标尺scale bar放置及大小设置、图像平滑处理及背景去除、plungin的安装使用、time series的分析、图像内任意切线的强度分布图。 | |
11:05-12:00 | ImageJ plugin的介绍及java编写imageJ plugin简单介绍、循环操作如何生成batch script(群操作脚本语言)。 | |
12:00-13:30 | 统一午餐 | |
第二天下午 | 13:30-14:30 | 蛋白结构解析方法介绍及如何用UCSF chemira显示蛋白结构、PDF文件格式及内容介绍、结构图像导出。 |
14:35-15:30 | Snapview软件演示,蛋白质数据库讲解及pdb数据格式介绍。 | |
15:35-17:00 | 通过最新发表文章图讲解理解科研作图基本规则,不同类型文章图制作流程,如何highlight图上重要的区域或者数据点。 | |
PS:务必携带电脑,要求windows系统。MAC请提前做好双系统或自己装好上课软件 | ||
软件安装Origin, ImageJ,Adobe Illustrator,UCSF Chimera, 3Dmax |